A Magyar Labdarúgó Szövetség versenybizottsága mindegyik NB I-es és NB II-es csapat nevezését elfogadta a Ligakupa következő kiírására, ás elkészítette a csoportok sorsolását. Mindegyik négyesbe két élvonalbeli és két másodosztályú csapat kapott besorolást.
A bajnoki aranyérmes Győri ETO azonos csoportba került a Ligakupa-címvédő Ferencvárossal. A csoportokban oda-visszavágós alapon dől el a helyezések sorrendje.
Ligakupa 2013–2014
A-csoport: Diósgyőr, MTK, Kisvárda, Vasas
B-csoport: Balmazújváros, Debreceni VSC, Mezőkövesd, Nyíregyháza Spartacus
C-csoport: Békéscsaba, Kecskemét, Szolnok, Újpest
D-csoport: Cegléd, Bp. Honvéd, Puskás Akadémia, Szigetszentmiklós
E-csoport: Dunaújváros PASE, Videoton, Kozármisleny, MVM Paks
F-csoport: Ferencváros, Győri ETO, Sopron, Tatabánya
G-csoport: FC Ajka, Gyirmót, Szombathelyi Haladás, Lombard Pápa
H-csoport: Siófok, Kaposvári Rákóczi, Pécsi MFC, Zalaegerszeg
