Mourinho 2008 és 2010 között már dolgozott az Inter vezetőedzőjeként, és a 2009/10-es idényben triplázott, megnyerte a bajnokságot, a kupát, valamint a Bajnokok Ligáját is, ami azóta egyetlen olasz csapatnak sem jött össze. A jelenlegi tréner, Luciano Spalletti alatt egyre melegebb a kispad, az együttes ugyanis sorozatban három bajnokin maradt nyeretlen és gólképtelen, 2019-ben még nem szerzett gólt a ligában, ráadásul a Bajnokok Ligája után hazai pályán esett ki az Olasz Kupából is.
Mourinho nagy népszerűségnek örvend Milánóban és ő maga sem titkolta, hogy családjaként tekint az Interre.